Nextflow ben írt könyvtárak
rnaseq
RNS szekvenálási elemzési folyamat STAR, RSEM, HISAT2 vagy Lazac felhasználásával, gén/izoforma számmal és kiterjedt minőségellenőrzéssel.
- 646
- MIT
sarek
Elemzési folyamat a csíravonal vagy szomatikus változatok kimutatására (előfeldolgozás, változathívás és megjegyzések) a WGS-ből / célzott szekvenálás.
- 256
- MIT
configs
Konfigurációs fájlok, amelyek a különböző intézmények számítási környezeteire jellemző paraméterek meghatározására szolgálnak (nf-core segítségével).
- 71
- MIT